Kan Çiçekleri'nde hayalleri ve ailesinin geleceği arasında sıkışıp kalan Dilan ile kan davasına son vermek isteyen Baran'ın hikâyesi anlatılıyor.
Dizi kan davasıyla başlayan büyük bir aşkı gözler önüne seriyor. Bu zoraki evlilik kan davasını bitirmeye yetecek mi... Ezelden düşman olan Dilan ve Baran yaşananları bir kenara bırakıp birbirlerinin yüzüne bakabilecek mi... İki kalp arasında sert rüzgarlar estiren bu ilişki aşka dönüşecek mi...
Kan Çiçekleri dizisinde, kardeşini töreye kurban vermek istemeyen Baran ve tüm hayallerini bir kenara koyup hiç tanımadığı biriyle evlenen Dilan'ın kanla yoğurulan zoraki evlilikleri konu ediliyor.